Los problemas de la primera sesión del GP de Azerbaiyán se repitieron en la segunda. El asfalto fue mejorando, pero fueron muchos los pilotos que sufrieron salidas de pista, aunque ninguno con serias consecuencias. Vettel tuvo que tomar las escapatorias tras su primera aparición, como harían luego Stroll, Hartley o Hamilton.
También tuvo un susto Verstappen, que salió a pista después de que Red Bull tuviera que cambiar el fondo plano al RB14 por su accidente en los libres 1. Tampoco había sido la mejor primera sesión para Sainz, que tuvo que bajarse del Renault antes de tiempo, y trató de recuperar tiempo siendo el primero en salir a la pista de Bakú cuando el semáforo se puso verde.
Gasly y Magnussen vivieron un momento de tensión cuando el danés superó al de Toro Rosso y estuvieron cerca de tocarse, provocando el enfado del francés por radio.
Con el neumático superblando de Pirelli, Ricciardo era el más rápido tras la primera media hora por delante de su compañero Verstappen y de Bottas. En ese momento, Alonso estaba 16º (sin velocidad punta) y Sainz 17º, sin grandes tiempos. Ericsson tuvo que volver a boxes con un problema en la caja de cambios.