Tras hacer buena su primera pole en MotoGP, Pedro Acosta mantuvo un ritmo imparable en la sprint de Motegi, liderando desde el tercer giro y mostrando una madurez impresionante en su debut en la categoría reina. Sin embargo, la emoción y la presión le jugaron una mala pasada cuando, en una curva a la izquierda, el español entró demasiado abierto, provocando su primera caída en una carrera corta y, con ello, perdiendo la oportunidad de alzarse con su primer triunfo parcial en MotoGP.
El error del joven piloto de GasGas dejó el camino libre a Pecco Bagnaia, que no desaprovechó la ocasión. Bagnaia, con su habitual solidez, se adjudicó su tercera victoria consecutiva en las sprints, consolidándose como uno de los pilotos más en forma de la temporada. Este resultado, unido a la cuarta posición de Jorge Martín, ha vuelto a poner patas arriba la pelea por el título. Aunque Martín sigue como líder del campeonato, su ventaja sobre el turinés se ha reducido a solo 15 puntos, dejando todo abierto para las próximas rondas.
Detrás de Bagnaia, la lucha por el podio fue intensa. Enea Bastianini y Marc Márquez protagonizaron un duelo emocionante en las últimas vueltas. Ambos pilotos fueron de menos a más a lo largo de la carrera, encontrándose cara a cara a dos vueltas del final. En un intercambio constante de posiciones, el catalán intentó superar al corredor de Rimini en dos ocasiones, pero Bastianini defendió ferozmente su posición, logrando finalmente asegurar el segundo puesto, mientras Márquez se tuvo que conformar con el tercer escalón del podio.
Jorge Martín, quien sufrió una caída en la segunda sesión de clasificación que le relegó a la undécima posición en la parrilla, tuvo una buena remontada en los primeros compases de la carrera, alcanzando la quinta plaza rápidamente. Sin embargo, después de ese esfuerzo inicial, no pudo progresar más y quedó atrapado en tierra de nadie. Su compañero de equipo en Pramac, Franco Morbidelli, cerró el top 5, seguido de Fabio Di Giannantonio, quien firmó una sólida sexta posición.
Más atrás, el séptimo puesto fue para Álex Márquez, que cruzó la meta a más de 11 segundos del ganador, seguido de Jack Miller, el mejor clasificado entre los pilotos de KTM. Antes de la caída de Acosta, la escudería austriaca ya había sufrido otro golpe con el abandono prematuro de Brad Binder debido a una avería en su RC16.
Maverick Viñales volvió a tener problemas en la salida y solo pudo ser noveno, mientras que Marco Bezzecchi cerró un top 10 sin representación de las marcas japonesas. El mejor de los pilotos de Yamaha fue Fabio Quartararo, que terminó 12º, evidenciando nuevamente las dificultades de las fábricas niponas.
Además de la caída de Acosta, otros pilotos que se fueron al suelo fueron Joan Mir, en la primera vuelta, y Aleix Espargaró. El piloto local Takaaki Nakagami también se vio fuera de carrera tras ser embestido sin contemplaciones por su compañero de equipo, Johann Zarco, quien fue penalizado con una vuelta larga en la carrera.
